Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SbdsP70122 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SbdsP70122 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SbdsP70122 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SbdsP70122 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SbdsP70122 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SbdsP70122 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SbdsP70122 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SbdsP70122 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SbdsP70122 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SbdsP70122 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SbdsP70122 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SbdsP70122 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SbdsP70122 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SbdsP70122 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SbdsP70122 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SbdsP70122 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SbdsP70122 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SbdsP70122 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SbdsP70122 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SbdsP70122 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SbdsP70122 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SbdsP70122 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SbdsP70122 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SbdsP70122 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SbdsP70122 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SbdsP70122 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SbdsP70122 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SbdsP70122 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SbdsP70122 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SbdsP70122 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SbdsP70122 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SbdsP70122 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SbdsP70122 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SbdsP70122 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SbdsP70122 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms