Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBBP68871 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBBP68871 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBBP68871 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HBBP68871 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBBP68871 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBBP68871 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBBP68871 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBBP68871 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HBBP68871 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HBBP68871 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HBBP68871 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HBBP68871 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HBBP68871 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HBBP68871 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HBBP68871 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HBBP68871 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBBP68871 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBBP68871 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBBP68871 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBBP68871 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBBP68871 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBBP68871 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBBP68871 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBBP68871 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBBP68871 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBBP68871 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HBBP68871 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBBP68871 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBBP68871 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBBP68871 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBBP68871 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HBBP68871 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HBBP68871 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HBBP68871 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HBBP68871 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HBBP68871 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HBBP68871 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HBBP68871 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HBBP68871 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HBBP68871 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HBBP68871 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HBBP68871 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HBBP68871 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HBBP68871 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HBBP68871 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HBBP68871 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HBBP68871 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HBBP68871 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HBBP68871 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HBBP68871 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HBBP68871 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HBBP68871 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HBBP68871 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HBBP68871 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HBBP68871 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HBBP68871 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HBBP68871 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HBBP68871 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HBBP68871 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HBBP68871 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HBBP68871 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HBBP68871 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HBBP68871 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HBBP68871 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HBBP68871 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HBBP68871 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HBBP68871 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HBBP68871 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HBBP68871 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HBBP68871 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HBBP68871 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HBBP68871 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HBBP68871 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HBBP68871 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HBBP68871 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HBBP68871 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HBBP68871 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HBBP68871 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HBBP68871 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HBBP68871 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HBBP68871 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HBBP68871 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HBBP68871 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HBBP68871 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HBBP68871 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HBBP68871 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HBBP68871 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HBBP68871 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HBBP68871 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HBBP68871 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HBBP68871 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HBBP68871 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HBBP68871 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HBBP68871 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HBBP68871 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HBBP68871 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HBBP68871 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HBBP68871 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HBBP68871 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms