Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBA4AP68366 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA4AP68366 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA4AP68366 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA4AP68366 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA4AP68366 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms