Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkacbP68181 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkacbP68181 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkacbP68181 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkacbP68181 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkacbP68181 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkacbP68181 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkacbP68181 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkacbP68181 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkacbP68181 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms