Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2BP67870 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK2BP67870 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK2BP67870 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSNK2BP67870 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK2BP67870 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms