Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAMP2P63027 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP2P63027 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAMP2P63027 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAMP2P63027 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP2P63027 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP2P63027 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP2P63027 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP2P63027 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP2P63027 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP2P63027 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP2P63027 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP2P63027 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP2P63027 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP2P63027 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP2P63027 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP2P63027 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VAMP2P63027 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAMP2P63027 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAMP2P63027 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAMP2P63027 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VAMP2P63027 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP2P63027 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VAMP2P63027 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP2P63027 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP2P63027 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP2P63027 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP2P63027 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP2P63027 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP2P63027 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP2P63027 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP2P63027 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP2P63027 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP2P63027 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms