Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG7P62955 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNG7P62955 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG7P62955 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG7P62955 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG7P62955 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG7P62955 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG7P62955 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG7P62955 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG7P62955 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG7P62955 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG7P62955 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms