Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RBX1P62877 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RBX1P62877 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBX1P62877 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBX1P62877 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBX1P62877 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBX1P62877 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBX1P62877 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBX1P62877 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBX1P62877 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBX1P62877 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBX1P62877 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBX1P62877 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBX1P62877 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBX1P62877 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBX1P62877 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBX1P62877 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBX1P62877 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBX1P62877 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBX1P62877 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBX1P62877 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBX1P62877 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBX1P62877 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBX1P62877 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBX1P62877 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBX1P62877 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBX1P62877 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBX1P62877 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBX1P62877 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBX1P62877 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBX1P62877 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBX1P62877 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBX1P62877 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBX1P62877 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBX1P62877 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBX1P62877 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBX1P62877 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBX1P62877 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBX1P62877 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBX1P62877 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBX1P62877 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBX1P62877 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBX1P62877 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBX1P62877 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBX1P62877 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBX1P62877 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBX1P62877 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBX1P62877 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBX1P62877 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBX1P62877 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBX1P62877 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBX1P62877 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBX1P62877 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBX1P62877 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBX1P62877 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBX1P62877 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBX1P62877 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBX1P62877 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBX1P62877 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBX1P62877 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBX1P62877 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBX1P62877 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBX1P62877 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBX1P62877 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBX1P62877 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBX1P62877 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBX1P62877 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBX1P62877 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBX1P62877 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBX1P62877 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBX1P62877 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBX1P62877 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBX1P62877 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBX1P62877 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBX1P62877 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBX1P62877 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBX1P62877 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBX1P62877 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBX1P62877 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBX1P62877 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBX1P62877 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBX1P62877 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBX1P62877 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBX1P62877 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBX1P62877 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBX1P62877 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBX1P62877 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBX1P62877 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBX1P62877 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBX1P62877 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBX1P62877 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBX1P62877 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBX1P62877 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBX1P62877 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBX1P62877 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBX1P62877 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBX1P62877 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBX1P62877 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBX1P62877 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBX1P62877 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms