Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB1P62873 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNB1P62873 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNB1P62873 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNB1P62873 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GNB1P62873 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNB1P62873 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNB1P62873 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNB1P62873 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNB1P62873 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNB1P62873 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNB1P62873 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNB1P62873 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNB1P62873 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNB1P62873 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNB1P62873 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GNB1P62873 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB1P62873 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB1P62873 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB1P62873 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB1P62873 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB1P62873 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB1P62873 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB1P62873 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB1P62873 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB1P62873 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB1P62873 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB1P62873 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB1P62873 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB1P62873 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB1P62873 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB1P62873 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB1P62873 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNB1P62873 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNB1P62873 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNB1P62873 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNB1P62873 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNB1P62873 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNB1P62873 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNB1P62873 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNB1P62873 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNB1P62873 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNB1P62873 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB1P62873 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB1P62873 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB1P62873 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB1P62873 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB1P62873 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB1P62873 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB1P62873 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB1P62873 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB1P62873 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNB1P62873 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNB1P62873 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNB1P62873 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNB1P62873 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNB1P62873 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNB1P62873 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNB1P62873 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNB1P62873 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNB1P62873 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNB1P62873 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNB1P62873 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNB1P62873 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNB1P62873 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNB1P62873 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNB1P62873 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNB1P62873 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GNB1P62873 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNB1P62873 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNB1P62873 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNB1P62873 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNB1P62873 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNB1P62873 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNB1P62873 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNB1P62873 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNB1P62873 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNB1P62873 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNB1P62873 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNB1P62873 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNB1P62873 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNB1P62873 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNB1P62873 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNB1P62873 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GNB1P62873 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNB1P62873 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNB1P62873 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNB1P62873 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNB1P62873 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNB1P62873 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNB1P62873 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GNB1P62873 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GNB1P62873 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GNB1P62873 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GNB1P62873 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GNB1P62873 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GNB1P62873 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GNB1P62873 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GNB1P62873 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GNB1P62873 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms