Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF6P62330 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF6P62330 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF6P62330 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF6P62330 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF6P62330 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF6P62330 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF6P62330 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF6P62330 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF6P62330 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF6P62330 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF6P62330 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF6P62330 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF6P62330 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF6P62330 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF6P62330 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF6P62330 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF6P62330 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF6P62330 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF6P62330 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF6P62330 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF6P62330 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF6P62330 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF6P62330 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARF6P62330 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF6P62330 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF6P62330 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF6P62330 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF6P62330 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF6P62330 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF6P62330 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF6P62330 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF6P62330 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF6P62330 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF6P62330 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF6P62330 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF6P62330 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF6P62330 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF6P62330 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF6P62330 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF6P62330 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF6P62330 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF6P62330 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF6P62330 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF6P62330 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF6P62330 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF6P62330 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF6P62330 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF6P62330 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF6P62330 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF6P62330 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF6P62330 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF6P62330 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF6P62330 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF6P62330 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF6P62330 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF6P62330 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF6P62330 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF6P62330 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF6P62330 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF6P62330 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF6P62330 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF6P62330 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF6P62330 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF6P62330 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF6P62330 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF6P62330 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARF6P62330 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF6P62330 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF6P62330 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF6P62330 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF6P62330 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF6P62330 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF6P62330 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF6P62330 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF6P62330 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF6P62330 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF6P62330 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF6P62330 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF6P62330 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF6P62330 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF6P62330 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF6P62330 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF6P62330 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF6P62330 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF6P62330 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF6P62330 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF6P62330 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF6P62330 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF6P62330 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF6P62330 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF6P62330 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF6P62330 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF6P62330 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF6P62330 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF6P62330 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF6P62330 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF6P62330 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF6P62330 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF6P62330 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms