Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps18P62270 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps18P62270 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps18P62270 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps18P62270 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps18P62270 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rps18P62270 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps18P62270 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps18P62270 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps18P62270 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps18P62270 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps18P62270 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps18P62270 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps18P62270 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps18P62270 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps18P62270 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps18P62270 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps18P62270 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps18P62270 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps18P62270 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps18P62270 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps18P62270 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps18P62270 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps18P62270 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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