Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBE2HP62256 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
UBE2HP62256 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBE2HP62256 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBE2HP62256 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBE2HP62256 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE2HP62256 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE2HP62256 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBE2HP62256 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBE2HP62256 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBE2HP62256 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBE2HP62256 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE2HP62256 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE2HP62256 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE2HP62256 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE2HP62256 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE2HP62256 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE2HP62256 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBE2HP62256 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBE2HP62256 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBE2HP62256 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE2HP62256 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE2HP62256 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms