Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copz1P61924 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copz1P61924 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copz1P61924 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copz1P61924 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copz1P61924 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copz1P61924 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copz1P61924 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copz1P61924 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copz1P61924 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copz1P61924 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copz1P61924 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Copz1P61924 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copz1P61924 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copz1P61924 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copz1P61924 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copz1P61924 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copz1P61924 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copz1P61924 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copz1P61924 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms