Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SnnP61807 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnnP61807 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnnP61807 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnnP61807 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SnnP61807 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SnnP61807 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnnP61807 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnnP61807 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnnP61807 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnnP61807 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnnP61807 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SnnP61807 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SnnP61807 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnnP61807 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnnP61807 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnnP61807 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SnnP61807 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SnnP61807 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnnP61807 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnnP61807 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnnP61807 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnnP61807 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnnP61807 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnnP61807 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnnP61807 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnnP61807 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnnP61807 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnnP61807 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnnP61807 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnnP61807 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnnP61807 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnnP61807 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnnP61807 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnnP61807 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnnP61807 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnnP61807 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnnP61807 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnnP61807 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnnP61807 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnnP61807 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnnP61807 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnnP61807 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnnP61807 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnnP61807 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnnP61807 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnnP61807 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnnP61807 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnnP61807 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnnP61807 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnnP61807 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SnnP61807 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnnP61807 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnnP61807 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnnP61807 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnnP61807 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnnP61807 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnnP61807 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnnP61807 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnnP61807 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnnP61807 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnnP61807 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnnP61807 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnnP61807 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SnnP61807 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnnP61807 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnnP61807 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnnP61807 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnnP61807 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnnP61807 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SnnP61807 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnnP61807 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnnP61807 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnnP61807 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnnP61807 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnnP61807 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnnP61807 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnnP61807 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnnP61807 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnnP61807 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnnP61807 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnnP61807 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnnP61807 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnnP61807 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnnP61807 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnnP61807 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SnnP61807 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SnnP61807 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SnnP61807 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnnP61807 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnnP61807 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnnP61807 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnnP61807 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnnP61807 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnnP61807 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnnP61807 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnnP61807 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnnP61807 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnnP61807 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnnP61807 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms