Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vbp1P61759 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vbp1P61759 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vbp1P61759 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vbp1P61759 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms