Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga11P61622 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga11P61622 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga11P61622 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga11P61622 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga11P61622 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itga11P61622 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga11P61622 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga11P61622 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga11P61622 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga11P61622 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga11P61622 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga11P61622 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga11P61622 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga11P61622 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga11P61622 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga11P61622 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga11P61622 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga11P61622 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga11P61622 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga11P61622 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Itga11P61622 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Itga11P61622 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga11P61622 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga11P61622 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga11P61622 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga11P61622 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga11P61622 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga11P61622 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga11P61622 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms