Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCALDP61601 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCALDP61601 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCALDP61601 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCALDP61601 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCALDP61601 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCALDP61601 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCALDP61601 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCALDP61601 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCALDP61601 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCALDP61601 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCALDP61601 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NCALDP61601 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCALDP61601 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCALDP61601 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NCALDP61601 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCALDP61601 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCALDP61601 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCALDP61601 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCALDP61601 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCALDP61601 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCALDP61601 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCALDP61601 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCALDP61601 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCALDP61601 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCALDP61601 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCALDP61601 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCALDP61601 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCALDP61601 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCALDP61601 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCALDP61601 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCALDP61601 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCALDP61601 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCALDP61601 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCALDP61601 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCALDP61601 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCALDP61601 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCALDP61601 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCALDP61601 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCALDP61601 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCALDP61601 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCALDP61601 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCALDP61601 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCALDP61601 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCALDP61601 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCALDP61601 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCALDP61601 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCALDP61601 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCALDP61601 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCALDP61601 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCALDP61601 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCALDP61601 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCALDP61601 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCALDP61601 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCALDP61601 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCALDP61601 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCALDP61601 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCALDP61601 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCALDP61601 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCALDP61601 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCALDP61601 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCALDP61601 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCALDP61601 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCALDP61601 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCALDP61601 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCALDP61601 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCALDP61601 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCALDP61601 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCALDP61601 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCALDP61601 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCALDP61601 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCALDP61601 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCALDP61601 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCALDP61601 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCALDP61601 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCALDP61601 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCALDP61601 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCALDP61601 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCALDP61601 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCALDP61601 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCALDP61601 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCALDP61601 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCALDP61601 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCALDP61601 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCALDP61601 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCALDP61601 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCALDP61601 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCALDP61601 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCALDP61601 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCALDP61601 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCALDP61601 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCALDP61601 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCALDP61601 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NCALDP61601 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCALDP61601 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCALDP61601 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCALDP61601 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCALDP61601 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCALDP61601 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCALDP61601 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms