Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTBP60709 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTBP60709 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTBP60709 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTBP60709 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTBP60709 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTBP60709 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTBP60709 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTBP60709 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTBP60709 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTBP60709 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTBP60709 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTBP60709 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTBP60709 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTBP60709 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTBP60709 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTBP60709 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTBP60709 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTBP60709 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTBP60709 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTBP60709 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTBP60709 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTBP60709 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTBP60709 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTBP60709 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTBP60709 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTBP60709 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTBP60709 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTBP60709 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTBP60709 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTBP60709 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTBP60709 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTBP60709 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTBP60709 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTBP60709 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTBP60709 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTBP60709 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTBP60709 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTBP60709 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTBP60709 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTBP60709 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTBP60709 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTBP60709 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTBP60709 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBP60709 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBP60709 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBP60709 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBP60709 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBP60709 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTBP60709 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBP60709 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBP60709 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBP60709 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTBP60709 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTBP60709 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTBP60709 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTBP60709 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTBP60709 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTBP60709 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTBP60709 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTBP60709 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTBP60709 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTBP60709 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTBP60709 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTBP60709 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTBP60709 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTBP60709 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTBP60709 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTBP60709 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTBP60709 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTBP60709 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTBP60709 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTBP60709 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTBP60709 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTBP60709 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTBP60709 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTBP60709 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTBP60709 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTBP60709 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTBP60709 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTBP60709 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTBP60709 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTBP60709 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTBP60709 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTBP60709 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTBP60709 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTBP60709 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTBP60709 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTBP60709 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTBP60709 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTBP60709 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTBP60709 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTBP60709 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTBP60709 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTBP60709 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTBP60709 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTBP60709 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTBP60709 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTBP60709 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTBP60709 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms