Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFB3P59826 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFB3P59826 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFB3P59826 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFB3P59826 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFB3P59826 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms