Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl8P59280 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl8P59280 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl8P59280 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl8P59280 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl8P59280 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl8P59280 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl8P59280 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl8P59280 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl8P59280 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl8P59280 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl8P59280 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl8P59280 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl8P59280 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms