Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Nphp4P59240 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nphp4P59240 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nphp4P59240 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nphp4P59240 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nphp4P59240 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nphp4P59240 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nphp4P59240 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nphp4P59240 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nphp4P59240 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nphp4P59240 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nphp4P59240 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Nphp4P59240 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nphp4P59240 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nphp4P59240 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nphp4P59240 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nphp4P59240 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nphp4P59240 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nphp4P59240 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nphp4P59240 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Nphp4P59240 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nphp4P59240 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nphp4P59240 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Nphp4P59240 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Nphp4P59240 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Nphp4P59240 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Nphp4P59240 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Nphp4P59240 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nphp4P59240 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nphp4P59240 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nphp4P59240 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Nphp4P59240 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Nphp4P59240 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Nphp4P59240 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nphp4P59240 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms