Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB15P59190 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB15P59190 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB15P59190 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB15P59190 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB15P59190 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB15P59190 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB15P59190 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB15P59190 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB15P59190 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB15P59190 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB15P59190 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB15P59190 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB15P59190 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB15P59190 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB15P59190 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB15P59190 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB15P59190 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB15P59190 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB15P59190 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB15P59190 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB15P59190 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB15P59190 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB15P59190 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB15P59190 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB15P59190 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB15P59190 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB15P59190 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB15P59190 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB15P59190 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB15P59190 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB15P59190 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB15P59190 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB15P59190 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB15P59190 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB15P59190 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB15P59190 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB15P59190 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB15P59190 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB15P59190 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB15P59190 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB15P59190 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB15P59190 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB15P59190 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB15P59190 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB15P59190 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB15P59190 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB15P59190 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB15P59190 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB15P59190 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB15P59190 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB15P59190 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB15P59190 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB15P59190 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB15P59190 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB15P59190 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB15P59190 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB15P59190 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB15P59190 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB15P59190 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB15P59190 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB15P59190 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB15P59190 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB15P59190 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB15P59190 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB15P59190 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB15P59190 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB15P59190 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB15P59190 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB15P59190 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB15P59190 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB15P59190 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB15P59190 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB15P59190 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB15P59190 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB15P59190 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB15P59190 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB15P59190 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB15P59190 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB15P59190 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB15P59190 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB15P59190 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB15P59190 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB15P59190 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB15P59190 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB15P59190 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB15P59190 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB15P59190 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB15P59190 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB15P59190 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB15P59190 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB15P59190 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB15P59190 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB15P59190 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB15P59190 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB15P59190 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB15P59190 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB15P59190 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB15P59190 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB15P59190 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms