Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Csrnp1P59054 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Csrnp1P59054 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Csrnp1P59054 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Csrnp1P59054 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Csrnp1P59054 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Csrnp1P59054 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Csrnp1P59054 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Csrnp1P59054 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Csrnp1P59054 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Csrnp1P59054 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Csrnp1P59054 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Csrnp1P59054 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Csrnp1P59054 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Csrnp1P59054 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Csrnp1P59054 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Csrnp1P59054 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Csrnp1P59054 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Csrnp1P59054 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Csrnp1P59054 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Csrnp1P59054 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Csrnp1P59054 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Csrnp1P59054 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Csrnp1P59054 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Csrnp1P59054 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp1P59054 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp1P59054 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Csrnp1P59054 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Csrnp1P59054 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms