Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3BP58499 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3BP58499 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3BP58499 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM3BP58499 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms