Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtnsP57757 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtnsP57757 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtnsP57757 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtnsP57757 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtnsP57757 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtnsP57757 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtnsP57757 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtnsP57757 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtnsP57757 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtnsP57757 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtnsP57757 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtnsP57757 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtnsP57757 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtnsP57757 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtnsP57757 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtnsP57757 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtnsP57757 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms