Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB25P57735 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB25P57735 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB25P57735 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB25P57735 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB25P57735 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB25P57735 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB25P57735 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB25P57735 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB25P57735 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB25P57735 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB25P57735 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB25P57735 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB25P57735 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB25P57735 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB25P57735 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB25P57735 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB25P57735 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB25P57735 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB25P57735 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB25P57735 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB25P57735 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB25P57735 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB25P57735 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB25P57735 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB25P57735 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB25P57735 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB25P57735 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB25P57735 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB25P57735 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB25P57735 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB25P57735 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB25P57735 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB25P57735 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB25P57735 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB25P57735 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB25P57735 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB25P57735 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB25P57735 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB25P57735 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB25P57735 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB25P57735 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB25P57735 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB25P57735 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB25P57735 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB25P57735 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB25P57735 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB25P57735 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB25P57735 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB25P57735 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB25P57735 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB25P57735 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB25P57735 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB25P57735 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB25P57735 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB25P57735 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB25P57735 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB25P57735 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB25P57735 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB25P57735 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB25P57735 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB25P57735 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB25P57735 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB25P57735 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB25P57735 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB25P57735 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB25P57735 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB25P57735 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB25P57735 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB25P57735 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB25P57735 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB25P57735 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB25P57735 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB25P57735 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB25P57735 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB25P57735 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB25P57735 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB25P57735 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB25P57735 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB25P57735 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB25P57735 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB25P57735 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB25P57735 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB25P57735 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB25P57735 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB25P57735 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB25P57735 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB25P57735 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB25P57735 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB25P57735 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB25P57735 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB25P57735 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB25P57735 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB25P57735 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB25P57735 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB25P57735 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB25P57735 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB25P57735 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB25P57735 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB25P57735 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms