Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SIK1P57059 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SIK1P57059 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SIK1P57059 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIK1P57059 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIK1P57059 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIK1P57059 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIK1P57059 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SIK1P57059 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SIK1P57059 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SIK1P57059 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SIK1P57059 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIK1P57059 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIK1P57059 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIK1P57059 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIK1P57059 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SIK1P57059 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SIK1P57059 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIK1P57059 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SIK1P57059 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIK1P57059 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIK1P57059 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIK1P57059 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIK1P57059 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIK1P57059 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIK1P57059 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIK1P57059 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIK1P57059 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIK1P57059 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIK1P57059 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIK1P57059 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIK1P57059 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIK1P57059 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIK1P57059 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIK1P57059 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIK1P57059 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIK1P57059 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SIK1P57059 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIK1P57059 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIK1P57059 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIK1P57059 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIK1P57059 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIK1P57059 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIK1P57059 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SIK1P57059 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIK1P57059 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIK1P57059 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIK1P57059 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIK1P57059 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIK1P57059 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIK1P57059 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SIK1P57059 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SIK1P57059 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SIK1P57059 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIK1P57059 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SIK1P57059 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIK1P57059 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIK1P57059 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIK1P57059 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIK1P57059 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIK1P57059 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIK1P57059 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SIK1P57059 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SIK1P57059 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SIK1P57059 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SIK1P57059 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SIK1P57059 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SIK1P57059 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIK1P57059 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIK1P57059 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIK1P57059 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIK1P57059 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIK1P57059 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIK1P57059 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIK1P57059 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIK1P57059 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SIK1P57059 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SIK1P57059 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SIK1P57059 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SIK1P57059 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SIK1P57059 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SIK1P57059 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIK1P57059 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIK1P57059 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIK1P57059 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIK1P57059 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIK1P57059 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIK1P57059 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SIK1P57059 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SIK1P57059 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIK1P57059 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms