Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn18P56857 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn18P56857 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn18P56857 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn18P56857 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn18P56857 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn18P56857 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn18P56857 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cldn18P56857 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn18P56857 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn18P56857 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn18P56857 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn18P56857 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn18P56857 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn18P56857 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn18P56857 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn18P56857 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn18P56857 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn18P56857 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn18P56857 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn18P56857 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn18P56857 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms