Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN18P56856 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN18P56856 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN18P56856 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN18P56856 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN18P56856 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN18P56856 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms