Protein–RNA interactions for Protein: P56703

WNT3, Proto-oncogene Wnt-3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3P56703 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3P56703 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3P56703 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3P56703 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3P56703 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3P56703 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WNT3P56703 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WNT3P56703 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3P56703 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3P56703 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3P56703 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3P56703 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3P56703 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3P56703 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3P56703 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3P56703 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3P56703 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3P56703 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WNT3P56703 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WNT3P56703 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
WNT3P56703 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WNT3P56703 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WNT3P56703 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WNT3P56703 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3P56703 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3P56703 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3P56703 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3P56703 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WNT3P56703 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WNT3P56703 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WNT3P56703 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WNT3P56703 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WNT3P56703 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3P56703 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WNT3P56703 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WNT3P56703 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WNT3P56703 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WNT3P56703 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3P56703 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3P56703 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3P56703 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3P56703 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3P56703 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3P56703 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3P56703 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3P56703 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3P56703 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WNT3P56703 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WNT3P56703 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WNT3P56703 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3P56703 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3P56703 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WNT3P56703 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WNT3P56703 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3P56703 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3P56703 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3P56703 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3P56703 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3P56703 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3P56703 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3P56703 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3P56703 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3P56703 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3P56703 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3P56703 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3P56703 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3P56703 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
WNT3P56703 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WNT3P56703 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3P56703 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3P56703 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3P56703 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3P56703 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT3P56703 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT3P56703 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT3P56703 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT3P56703 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT3P56703 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT3P56703 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT3P56703 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT3P56703 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WNT3P56703 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WNT3P56703 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT3P56703 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT3P56703 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT3P56703 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WNT3P56703 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WNT3P56703 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WNT3P56703 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WNT3P56703 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WNT3P56703 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT3P56703 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT3P56703 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT3P56703 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WNT3P56703 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WNT3P56703 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WNT3P56703 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WNT3P56703 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT3P56703 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT3P56703 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms