Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms