Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd38P56528 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd38P56528 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd38P56528 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd38P56528 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd38P56528 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd38P56528 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd38P56528 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd38P56528 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd38P56528 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd38P56528 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd38P56528 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd38P56528 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd38P56528 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd38P56528 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd38P56528 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd38P56528 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd38P56528 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd38P56528 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd38P56528 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd38P56528 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd38P56528 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms