Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAG2P55895 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAG2P55895 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAG2P55895 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAG2P55895 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAG2P55895 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAG2P55895 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAG2P55895 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAG2P55895 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAG2P55895 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAG2P55895 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAG2P55895 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAG2P55895 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAG2P55895 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAG2P55895 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAG2P55895 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAG2P55895 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAG2P55895 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAG2P55895 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAG2P55895 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAG2P55895 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAG2P55895 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAG2P55895 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAG2P55895 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAG2P55895 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAG2P55895 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAG2P55895 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAG2P55895 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAG2P55895 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAG2P55895 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAG2P55895 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAG2P55895 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAG2P55895 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAG2P55895 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAG2P55895 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAG2P55895 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAG2P55895 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAG2P55895 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAG2P55895 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAG2P55895 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAG2P55895 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAG2P55895 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAG2P55895 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAG2P55895 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAG2P55895 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAG2P55895 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAG2P55895 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAG2P55895 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAG2P55895 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAG2P55895 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAG2P55895 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAG2P55895 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAG2P55895 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAG2P55895 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAG2P55895 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAG2P55895 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAG2P55895 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAG2P55895 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAG2P55895 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAG2P55895 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAG2P55895 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAG2P55895 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAG2P55895 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAG2P55895 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAG2P55895 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAG2P55895 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAG2P55895 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAG2P55895 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAG2P55895 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAG2P55895 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAG2P55895 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAG2P55895 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAG2P55895 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAG2P55895 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAG2P55895 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAG2P55895 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAG2P55895 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAG2P55895 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAG2P55895 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAG2P55895 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAG2P55895 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAG2P55895 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAG2P55895 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAG2P55895 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAG2P55895 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAG2P55895 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAG2P55895 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAG2P55895 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAG2P55895 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms