Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LIM2P55344 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIM2P55344 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIM2P55344 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIM2P55344 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIM2P55344 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIM2P55344 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIM2P55344 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIM2P55344 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIM2P55344 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIM2P55344 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LIM2P55344 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIM2P55344 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIM2P55344 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIM2P55344 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIM2P55344 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIM2P55344 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIM2P55344 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LIM2P55344 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIM2P55344 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIM2P55344 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LIM2P55344 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIM2P55344 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIM2P55344 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIM2P55344 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIM2P55344 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIM2P55344 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIM2P55344 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIM2P55344 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIM2P55344 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIM2P55344 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIM2P55344 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIM2P55344 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIM2P55344 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIM2P55344 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIM2P55344 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIM2P55344 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIM2P55344 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIM2P55344 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LIM2P55344 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIM2P55344 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIM2P55344 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIM2P55344 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIM2P55344 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIM2P55344 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIM2P55344 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIM2P55344 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIM2P55344 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIM2P55344 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIM2P55344 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIM2P55344 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LIM2P55344 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIM2P55344 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIM2P55344 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIM2P55344 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LIM2P55344 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIM2P55344 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIM2P55344 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIM2P55344 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIM2P55344 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIM2P55344 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIM2P55344 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LIM2P55344 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIM2P55344 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIM2P55344 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIM2P55344 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIM2P55344 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIM2P55344 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIM2P55344 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIM2P55344 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIM2P55344 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIM2P55344 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LIM2P55344 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIM2P55344 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIM2P55344 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIM2P55344 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIM2P55344 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIM2P55344 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LIM2P55344 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIM2P55344 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIM2P55344 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIM2P55344 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIM2P55344 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LIM2P55344 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIM2P55344 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIM2P55344 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIM2P55344 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIM2P55344 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIM2P55344 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIM2P55344 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIM2P55344 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIM2P55344 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIM2P55344 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIM2P55344 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIM2P55344 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIM2P55344 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIM2P55344 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIM2P55344 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIM2P55344 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIM2P55344 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms