Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN2DP55273 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2DP55273 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2DP55273 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2DP55273 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN2DP55273 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2DP55273 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKN2DP55273 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKN2DP55273 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDKN2DP55273 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDKN2DP55273 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 568.7 ms