Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CASP7P55210 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CASP7P55210 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CASP7P55210 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CASP7P55210 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CASP7P55210 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CASP7P55210 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CASP7P55210 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CASP7P55210 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CASP7P55210 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CASP7P55210 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CASP7P55210 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CASP7P55210 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CASP7P55210 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CASP7P55210 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CASP7P55210 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CASP7P55210 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CASP7P55210 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CASP7P55210 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CASP7P55210 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CASP7P55210 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CASP7P55210 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CASP7P55210 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CASP7P55210 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CASP7P55210 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CASP7P55210 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CASP7P55210 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CASP7P55210 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CASP7P55210 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CASP7P55210 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CASP7P55210 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CASP7P55210 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CASP7P55210 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CASP7P55210 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CASP7P55210 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CASP7P55210 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CASP7P55210 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CASP7P55210 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CASP7P55210 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CASP7P55210 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CASP7P55210 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CASP7P55210 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CASP7P55210 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CASP7P55210 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CASP7P55210 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CASP7P55210 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CASP7P55210 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CASP7P55210 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CASP7P55210 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CASP7P55210 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CASP7P55210 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CASP7P55210 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CASP7P55210 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CASP7P55210 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CASP7P55210 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CASP7P55210 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CASP7P55210 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CASP7P55210 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CASP7P55210 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CASP7P55210 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CASP7P55210 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CASP7P55210 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CASP7P55210 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CASP7P55210 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CASP7P55210 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CASP7P55210 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CASP7P55210 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CASP7P55210 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CASP7P55210 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CASP7P55210 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CASP7P55210 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CASP7P55210 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CASP7P55210 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CASP7P55210 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CASP7P55210 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CASP7P55210 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CASP7P55210 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CASP7P55210 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CASP7P55210 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CASP7P55210 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CASP7P55210 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CASP7P55210 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CASP7P55210 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CASP7P55210 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CASP7P55210 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CASP7P55210 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CASP7P55210 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CASP7P55210 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CASP7P55210 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CASP7P55210 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CASP7P55210 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CASP7P55210 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CASP7P55210 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CASP7P55210 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CASP7P55210 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CASP7P55210 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CASP7P55210 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CASP7P55210 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CASP7P55210 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CASP7P55210 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms