Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELLP55199 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELLP55199 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELLP55199 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELLP55199 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELLP55199 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELLP55199 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELLP55199 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELLP55199 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELLP55199 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELLP55199 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELLP55199 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELLP55199 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELLP55199 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELLP55199 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELLP55199 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELLP55199 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELLP55199 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELLP55199 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELLP55199 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELLP55199 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELLP55199 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELLP55199 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELLP55199 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELLP55199 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELLP55199 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ELLP55199 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ELLP55199 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELLP55199 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ELLP55199 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELLP55199 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELLP55199 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELLP55199 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELLP55199 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELLP55199 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELLP55199 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELLP55199 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELLP55199 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELLP55199 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ELLP55199 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELLP55199 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELLP55199 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ELLP55199 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELLP55199 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELLP55199 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ELLP55199 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELLP55199 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELLP55199 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELLP55199 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELLP55199 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELLP55199 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELLP55199 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELLP55199 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELLP55199 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELLP55199 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELLP55199 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELLP55199 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELLP55199 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELLP55199 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELLP55199 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELLP55199 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELLP55199 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELLP55199 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELLP55199 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELLP55199 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ELLP55199 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELLP55199 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELLP55199 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELLP55199 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELLP55199 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELLP55199 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELLP55199 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELLP55199 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELLP55199 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELLP55199 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELLP55199 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELLP55199 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELLP55199 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELLP55199 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ELLP55199 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELLP55199 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELLP55199 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELLP55199 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELLP55199 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELLP55199 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ELLP55199 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELLP55199 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELLP55199 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ELLP55199 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ELLP55199 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ELLP55199 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELLP55199 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELLP55199 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELLP55199 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELLP55199 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELLP55199 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ELLP55199 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELLP55199 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELLP55199 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELLP55199 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms