Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AQP4P55087 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AQP4P55087 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AQP4P55087 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AQP4P55087 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AQP4P55087 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AQP4P55087 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AQP4P55087 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AQP4P55087 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AQP4P55087 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AQP4P55087 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AQP4P55087 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AQP4P55087 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AQP4P55087 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AQP4P55087 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AQP4P55087 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AQP4P55087 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AQP4P55087 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AQP4P55087 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AQP4P55087 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AQP4P55087 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AQP4P55087 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AQP4P55087 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AQP4P55087 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AQP4P55087 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AQP4P55087 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AQP4P55087 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AQP4P55087 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AQP4P55087 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AQP4P55087 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AQP4P55087 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AQP4P55087 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AQP4P55087 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AQP4P55087 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AQP4P55087 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AQP4P55087 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AQP4P55087 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AQP4P55087 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AQP4P55087 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AQP4P55087 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AQP4P55087 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AQP4P55087 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AQP4P55087 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AQP4P55087 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AQP4P55087 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AQP4P55087 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AQP4P55087 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AQP4P55087 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AQP4P55087 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AQP4P55087 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AQP4P55087 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AQP4P55087 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AQP4P55087 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AQP4P55087 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AQP4P55087 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AQP4P55087 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AQP4P55087 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AQP4P55087 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AQP4P55087 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AQP4P55087 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AQP4P55087 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AQP4P55087 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AQP4P55087 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AQP4P55087 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AQP4P55087 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AQP4P55087 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AQP4P55087 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AQP4P55087 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AQP4P55087 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AQP4P55087 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AQP4P55087 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AQP4P55087 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AQP4P55087 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AQP4P55087 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AQP4P55087 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AQP4P55087 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AQP4P55087 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AQP4P55087 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AQP4P55087 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AQP4P55087 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AQP4P55087 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AQP4P55087 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AQP4P55087 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AQP4P55087 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AQP4P55087 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AQP4P55087 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AQP4P55087 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AQP4P55087 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AQP4P55087 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AQP4P55087 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AQP4P55087 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AQP4P55087 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AQP4P55087 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AQP4P55087 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AQP4P55087 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AQP4P55087 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AQP4P55087 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AQP4P55087 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AQP4P55087 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AQP4P55087 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms