Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PltpP55065 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PltpP55065 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PltpP55065 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PltpP55065 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PltpP55065 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PltpP55065 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PltpP55065 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PltpP55065 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PltpP55065 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PltpP55065 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PltpP55065 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PltpP55065 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PltpP55065 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PltpP55065 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PltpP55065 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PltpP55065 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PltpP55065 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PltpP55065 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PltpP55065 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PltpP55065 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PltpP55065 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PltpP55065 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PltpP55065 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PltpP55065 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PltpP55065 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PltpP55065 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PltpP55065 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PltpP55065 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PltpP55065 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PltpP55065 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PltpP55065 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PltpP55065 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PltpP55065 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PltpP55065 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PltpP55065 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PltpP55065 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PltpP55065 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PltpP55065 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PltpP55065 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PltpP55065 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PltpP55065 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PltpP55065 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PltpP55065 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PltpP55065 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PltpP55065 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PltpP55065 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PltpP55065 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PltpP55065 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PltpP55065 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PltpP55065 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PltpP55065 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PltpP55065 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PltpP55065 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PltpP55065 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PltpP55065 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PltpP55065 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PltpP55065 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PltpP55065 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PltpP55065 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PltpP55065 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PltpP55065 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PltpP55065 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PltpP55065 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PltpP55065 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PltpP55065 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PltpP55065 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PltpP55065 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PltpP55065 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PltpP55065 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PltpP55065 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PltpP55065 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PltpP55065 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PltpP55065 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PltpP55065 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PltpP55065 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PltpP55065 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PltpP55065 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PltpP55065 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PltpP55065 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PltpP55065 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PltpP55065 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PltpP55065 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PltpP55065 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PltpP55065 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PltpP55065 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PltpP55065 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PltpP55065 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PltpP55065 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PltpP55065 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PltpP55065 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PltpP55065 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PltpP55065 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PltpP55065 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PltpP55065 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PltpP55065 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PltpP55065 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PltpP55065 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PltpP55065 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PltpP55065 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms