Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GYS2P54840 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GYS2P54840 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GYS2P54840 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GYS2P54840 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GYS2P54840 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GYS2P54840 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GYS2P54840 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GYS2P54840 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GYS2P54840 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GYS2P54840 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GYS2P54840 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GYS2P54840 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GYS2P54840 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GYS2P54840 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GYS2P54840 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GYS2P54840 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GYS2P54840 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GYS2P54840 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GYS2P54840 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GYS2P54840 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GYS2P54840 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GYS2P54840 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GYS2P54840 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GYS2P54840 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GYS2P54840 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GYS2P54840 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GYS2P54840 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GYS2P54840 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GYS2P54840 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GYS2P54840 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GYS2P54840 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GYS2P54840 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GYS2P54840 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GYS2P54840 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GYS2P54840 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GYS2P54840 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GYS2P54840 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GYS2P54840 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GYS2P54840 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GYS2P54840 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GYS2P54840 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GYS2P54840 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GYS2P54840 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GYS2P54840 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GYS2P54840 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GYS2P54840 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GYS2P54840 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GYS2P54840 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GYS2P54840 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GYS2P54840 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GYS2P54840 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GYS2P54840 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GYS2P54840 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GYS2P54840 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GYS2P54840 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GYS2P54840 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GYS2P54840 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GYS2P54840 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GYS2P54840 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GYS2P54840 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GYS2P54840 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GYS2P54840 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GYS2P54840 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GYS2P54840 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GYS2P54840 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GYS2P54840 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GYS2P54840 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GYS2P54840 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GYS2P54840 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GYS2P54840 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GYS2P54840 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GYS2P54840 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GYS2P54840 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GYS2P54840 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GYS2P54840 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GYS2P54840 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GYS2P54840 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GYS2P54840 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GYS2P54840 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GYS2P54840 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GYS2P54840 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GYS2P54840 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GYS2P54840 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GYS2P54840 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GYS2P54840 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GYS2P54840 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GYS2P54840 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GYS2P54840 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GYS2P54840 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GYS2P54840 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GYS2P54840 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GYS2P54840 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GYS2P54840 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GYS2P54840 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GYS2P54840 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GYS2P54840 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GYS2P54840 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GYS2P54840 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GYS2P54840 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms