Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP3M2P53677 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP3M2P53677 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP3M2P53677 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AP3M2P53677 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP3M2P53677 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AP3M2P53677 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP3M2P53677 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms