Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRYBA4P53673 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CRYBA4P53673 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBA4P53673 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms