Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NUP98P52948 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NUP98P52948 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NUP98P52948 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP98P52948 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP98P52948 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP98P52948 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP98P52948 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP98P52948 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP98P52948 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP98P52948 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP98P52948 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP98P52948 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP98P52948 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP98P52948 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP98P52948 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP98P52948 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP98P52948 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP98P52948 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP98P52948 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP98P52948 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP98P52948 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP98P52948 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP98P52948 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP98P52948 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP98P52948 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP98P52948 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP98P52948 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP98P52948 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP98P52948 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP98P52948 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP98P52948 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP98P52948 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP98P52948 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP98P52948 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP98P52948 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP98P52948 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP98P52948 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP98P52948 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP98P52948 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP98P52948 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP98P52948 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP98P52948 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP98P52948 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP98P52948 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP98P52948 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUP98P52948 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP98P52948 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP98P52948 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP98P52948 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
NUP98P52948 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP98P52948 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP98P52948 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP98P52948 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP98P52948 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP98P52948 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP98P52948 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP98P52948 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP98P52948 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP98P52948 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP98P52948 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP98P52948 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP98P52948 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUP98P52948 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUP98P52948 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP98P52948 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP98P52948 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP98P52948 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP98P52948 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP98P52948 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP98P52948 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP98P52948 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP98P52948 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP98P52948 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP98P52948 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP98P52948 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP98P52948 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP98P52948 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP98P52948 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP98P52948 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP98P52948 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP98P52948 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP98P52948 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP98P52948 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP98P52948 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP98P52948 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP98P52948 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP98P52948 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP98P52948 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP98P52948 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP98P52948 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP98P52948 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP98P52948 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP98P52948 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP98P52948 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP98P52948 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP98P52948 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP98P52948 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP98P52948 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP98P52948 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms