Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2JP52435 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2JP52435 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2JP52435 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2JP52435 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2JP52435 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2JP52435 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms