Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLCN3P51790 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLCN3P51790 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN3P51790 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN3P51790 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN3P51790 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLCN3P51790 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLCN3P51790 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLCN3P51790 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN3P51790 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCN3P51790 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLCN3P51790 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN3P51790 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLCN3P51790 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN3P51790 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN3P51790 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms