Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCR5P51681 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCR5P51681 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR5P51681 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR5P51681 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR5P51681 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR5P51681 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR5P51681 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR5P51681 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCR5P51681 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCR5P51681 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCR5P51681 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCR5P51681 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCR5P51681 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCR5P51681 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCR5P51681 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCR5P51681 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCR5P51681 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR5P51681 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR5P51681 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCR5P51681 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCR5P51681 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCR5P51681 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCR5P51681 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCR5P51681 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCR5P51681 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCR5P51681 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCR5P51681 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCR5P51681 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCR5P51681 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCR5P51681 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCR5P51681 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCR5P51681 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCR5P51681 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCR5P51681 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCR5P51681 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCR5P51681 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCR5P51681 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR5P51681 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCR5P51681 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCR5P51681 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCR5P51681 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCR5P51681 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCR5P51681 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCR5P51681 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCR5P51681 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCR5P51681 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCR5P51681 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCR5P51681 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCR5P51681 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCR5P51681 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCR5P51681 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCR5P51681 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCR5P51681 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCR5P51681 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCR5P51681 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCR5P51681 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCR5P51681 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCR5P51681 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCR5P51681 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCR5P51681 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCR5P51681 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCR5P51681 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCR5P51681 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCR5P51681 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCR5P51681 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCR5P51681 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCR5P51681 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCR5P51681 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCR5P51681 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCR5P51681 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCR5P51681 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCR5P51681 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCR5P51681 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCR5P51681 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCR5P51681 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCR5P51681 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCR5P51681 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCR5P51681 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCR5P51681 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCR5P51681 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCR5P51681 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCR5P51681 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCR5P51681 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCR5P51681 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCR5P51681 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCR5P51681 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCR5P51681 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCR5P51681 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCR5P51681 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms