Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB5CP51148 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB5CP51148 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RAB5CP51148 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB5CP51148 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB5CP51148 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms