Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa6P50704 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa6P50704 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa6P50704 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa6P50704 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa6P50704 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa6P50704 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa6P50704 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa6P50704 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa6P50704 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms