Protein–RNA interactions for Protein: P50518

Atp6v1e1, V-type proton ATPase subunit E 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e1P50518 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp6v1e1P50518 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp6v1e1P50518 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp6v1e1P50518 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6v1e1P50518 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp6v1e1P50518 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp6v1e1P50518 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms