Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRP3P50461 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRP3P50461 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRP3P50461 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRP3P50461 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRP3P50461 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms